心。
至明末，达延汗重建的蒙古汗国传承至林丹汗。
林丹汗直辖察哈尔部，又是整个东蒙古，鞑靼的总汗。
后金兴起后，其征服蒙古，卫拉特部除外，明又称瓦剌。
万历四十四年，1616年，努尔哈赤统一
真各部，建立后金。
林丹汗与结盟，联手遏制后金。
天命四年，1619年，后金在辽河大败喀尔喀蒙古军，俘获喀尔喀、扎鲁特的多位
领。
天命六年，1621年，后金攻克明军驻守的沈阳，进而攻打辽阳。
喀尔喀部乘机偷袭沈阳，但被后金击败。
不久，喀尔喀部台吉古尔布什、莽古勒等率六百户投奔后金，努尔哈赤将其嫁予古尔布什。
此后，对林丹汗心怀不满的一部分喀尔喀、扎鲁特台吉投靠努尔哈赤。
天命九年，1624年，科尔沁部首领奥
向努尔哈赤称臣，首先归附后金。
次年，林丹汗发兵讨伐科尔沁部，努尔哈赤命莽古尔泰、等前往救援，林丹汗被迫退兵。
天命十一年，1626年，后金征林部、扎鲁特部，掠其
、牲畜而归。
天聪元年，1627年，柰曼、敖汉二部归附后金。
次年，喀喇沁部归附，发兵征察哈尔。
之后，扎鲁特部归附后金。
天聪四年，1630年，四子部落、阿噜科尔沁部归附。
天聪六年，1632年，翁牛特部归附。
四月，再征察哈尔，令喀喇沁、扎鲁特、敖汉、柰曼、翁牛特、林、科尔沁等部前来会师。
但蒙古各部多不愿与察哈尔
战。
五月，后金进军至归化城，林丹汗南渡黄河，逃往鄂尔多斯。
后金俘获察哈尔数千。次年，茂明安部、乌喇特部归附。
天聪八年，1634年，林丹汗病死于大
滩，察哈尔、克什克腾部众相继归降。
次年，1635年四月，林丹汗之子额哲出降，献元代传国玺“制诰之寳”，察哈尔部灭亡。
鄂尔多斯部、归化城土默特一并归降。
天聪十年，1636年四月，漠南蒙古各部王公台吉来盛京朝觐，奉为蒙古大汗。
改国号为大清。类似于唐帝对原地区自称天可汗。
清主在汉地称帝的同时，也同时声称继承了蒙古的汗位，并得到了蒙古诸部的背书承认。
但李唐对于原地区就是简单册封部落首领官职，并对部落冠以州名，最后再加以外制衡，避免出现独大。
其效果甚至不如明代的经济制衡，突厥、薛延陀、回鹘、黠戛斯、契丹诸部竞相崛起，唐在漠北获得了一次次的战术胜利，却总是换来新的原之主。
清代另辟蹊径，构建出了一套针对牧区的地方行政体系，盟旗制，将游牧部落齐民编户，禁锢在各自的小片土地上。
实质上，是将前代的众建分其势的治理原则，予以制度化。
清廷采取了直接统治的策略，称蒙古大汗，宣称直接继承了蒙古帝国法统；奉黄教，笼络蒙古各部的宗教势力。
对战略要点建城并驻军，由各路将军统辖。
对蒙古基层采取盟旗制，离散部落、齐民编户。
盟旗制大体如下清对归附的蒙古部众，按盟旗原则重新安置归附的蒙古诸部，直至全蒙古部众悉数被纳
盟旗体制。
其中，旗是清廷设在蒙古地区的基层行政单位，在法理上是清朝皇帝，也就是蒙古大汗，赐给旗主的世袭领地。
旗经过编织佐领，安置属民，分给牧地，划定旗界，通过任命札萨克（执政官）而形成。盟为旗的会盟组织，合数旗而成。
每盟设正副盟长各一，由清帝派兼摄。盟长的主要任务是充当三年一次的会盟召集，履行比丁、练兵、清查钱谷、审理重大刑名案件、监督属下各旗等职责，但无发兵权。
同时，清代严格限制各旗属民越旗游牧、耕种、往来、婚嫁。盟旗制下，蒙古诸部的经济基础实质上已从游牧制转变成畜牧制，实现了土地紧密结合，方便清廷统治。
至此，蒙古旧地被分割成内属、外藩共计262旗。其中外藩蒙古各旗主的权柄已形同西南土司，而内属蒙古甚至已经实现“改土归流”，由清帝直接派遣旗主。
有清一代，牧区再也无法自发形成新的权力中心，或者说，清廷成功把自己打造成了蒙古高原的新核心。
汉武帝大举讨伐匈
，到匈分裂，南匈内附，再到匈统一，扶植汉
政权，再到匈再次分裂，东汉驱逐北匈。两汉四百年，能比较有效的羁縻南匈的岁月合起来都不到一百年。而东汉驱逐了北匈，北匈的地盘也不过是被鲜卑占据。
而鲜卑，南匈，羌的骚扰
